Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lactb2Q99KR3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lactb2Q99KR3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lactb2Q99KR3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lactb2Q99KR3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lactb2Q99KR3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lactb2Q99KR3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Lactb2Q99KR3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lactb2Q99KR3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lactb2Q99KR3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lactb2Q99KR3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lactb2Q99KR3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lactb2Q99KR3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lactb2Q99KR3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lactb2Q99KR3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lactb2Q99KR3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lactb2Q99KR3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.8 ms