Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Higd1bQ99JY6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Higd1bQ99JY6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1bQ99JY6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199.1 ms