Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tspan1Q99J59 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan1Q99J59 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan1Q99J59 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms