Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ophn1Q99J31 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ophn1Q99J31 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ophn1Q99J31 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms