Protein–RNA interactions for Protein: Q925I1

Atad3, ATPase family AAA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad3Q925I1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atad3Q925I1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atad3Q925I1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atad3Q925I1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atad3Q925I1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms