Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubb6Q922F4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubb6Q922F4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubb6Q922F4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubb6Q922F4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubb6Q922F4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubb6Q922F4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubb6Q922F4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubb6Q922F4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubb6Q922F4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubb6Q922F4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tubb6Q922F4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tubb6Q922F4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubb6Q922F4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tubb6Q922F4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms