Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdha12Q91Y18 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdha12Q91Y18 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdha12Q91Y18 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms