Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y15

Pcdha5, Protocadherin alpha 5, mousemouse

Predictions only

Length 934 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha5Q91Y15 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdha5Q91Y15 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha5Q91Y15 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdha5Q91Y15 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha5Q91Y15 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha5Q91Y15 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha5Q91Y15 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha5Q91Y15 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha5Q91Y15 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha5Q91Y15 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha5Q91Y15 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha5Q91Y15 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha5Q91Y15 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha5Q91Y15 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha5Q91Y15 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha5Q91Y15 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha5Q91Y15 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha5Q91Y15 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha5Q91Y15 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha5Q91Y15 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha5Q91Y15 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha5Q91Y15 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha5Q91Y15 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.4 ms