Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmco4Q91WU4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmco4Q91WU4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmco4Q91WU4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmco4Q91WU4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmco4Q91WU4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmco4Q91WU4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmco4Q91WU4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmco4Q91WU4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmco4Q91WU4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmco4Q91WU4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmco4Q91WU4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmco4Q91WU4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmco4Q91WU4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmco4Q91WU4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmco4Q91WU4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmco4Q91WU4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmco4Q91WU4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms