Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sgms1Q8VCQ6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sgms1Q8VCQ6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sgms1Q8VCQ6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sgms1Q8VCQ6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sgms1Q8VCQ6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sgms1Q8VCQ6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sgms1Q8VCQ6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sgms1Q8VCQ6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sgms1Q8VCQ6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sgms1Q8VCQ6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sgms1Q8VCQ6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sgms1Q8VCQ6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sgms1Q8VCQ6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sgms1Q8VCQ6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sgms1Q8VCQ6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sgms1Q8VCQ6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sgms1Q8VCQ6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sgms1Q8VCQ6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sgms1Q8VCQ6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sgms1Q8VCQ6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sgms1Q8VCQ6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sgms1Q8VCQ6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sgms1Q8VCQ6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sgms1Q8VCQ6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sgms1Q8VCQ6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sgms1Q8VCQ6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms