Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BbxQ8VBW5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.6 ms