Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpm8Q8R4D5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpm8Q8R4D5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpm8Q8R4D5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpm8Q8R4D5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpm8Q8R4D5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpm8Q8R4D5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpm8Q8R4D5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpm8Q8R4D5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpm8Q8R4D5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpm8Q8R4D5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpm8Q8R4D5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpm8Q8R4D5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpm8Q8R4D5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpm8Q8R4D5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpm8Q8R4D5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpm8Q8R4D5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpm8Q8R4D5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpm8Q8R4D5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpm8Q8R4D5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpm8Q8R4D5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpm8Q8R4D5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpm8Q8R4D5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpm8Q8R4D5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpm8Q8R4D5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpm8Q8R4D5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trpm8Q8R4D5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpm8Q8R4D5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms