Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam228aQ8CDW1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam228aQ8CDW1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms