Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc15Q8C9M2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc15Q8C9M2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc15Q8C9M2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc15Q8C9M2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc15Q8C9M2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc15Q8C9M2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc15Q8C9M2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc15Q8C9M2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc15Q8C9M2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc15Q8C9M2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc15Q8C9M2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc15Q8C9M2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms