Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9H6

Strip2, Striatin-interacting proteins 2, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip2Q8C9H6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strip2Q8C9H6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Strip2Q8C9H6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Strip2Q8C9H6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Strip2Q8C9H6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strip2Q8C9H6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strip2Q8C9H6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strip2Q8C9H6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strip2Q8C9H6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strip2Q8C9H6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strip2Q8C9H6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strip2Q8C9H6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strip2Q8C9H6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strip2Q8C9H6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strip2Q8C9H6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strip2Q8C9H6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strip2Q8C9H6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strip2Q8C9H6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strip2Q8C9H6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strip2Q8C9H6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strip2Q8C9H6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Strip2Q8C9H6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strip2Q8C9H6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strip2Q8C9H6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strip2Q8C9H6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strip2Q8C9H6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strip2Q8C9H6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strip2Q8C9H6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strip2Q8C9H6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strip2Q8C9H6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Strip2Q8C9H6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strip2Q8C9H6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strip2Q8C9H6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strip2Q8C9H6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strip2Q8C9H6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strip2Q8C9H6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strip2Q8C9H6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strip2Q8C9H6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strip2Q8C9H6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strip2Q8C9H6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strip2Q8C9H6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strip2Q8C9H6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strip2Q8C9H6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Strip2Q8C9H6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Strip2Q8C9H6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Strip2Q8C9H6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Strip2Q8C9H6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strip2Q8C9H6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms