Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ppfibp1Q8C8U0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfibp1Q8C8U0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms