Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Alx1Q8C8B0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Alx1Q8C8B0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Alx1Q8C8B0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Alx1Q8C8B0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Alx1Q8C8B0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Alx1Q8C8B0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Alx1Q8C8B0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Alx1Q8C8B0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Alx1Q8C8B0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Alx1Q8C8B0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Alx1Q8C8B0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Alx1Q8C8B0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Alx1Q8C8B0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Alx1Q8C8B0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Alx1Q8C8B0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Alx1Q8C8B0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Alx1Q8C8B0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Alx1Q8C8B0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Alx1Q8C8B0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Alx1Q8C8B0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Alx1Q8C8B0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Alx1Q8C8B0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Alx1Q8C8B0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Alx1Q8C8B0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Alx1Q8C8B0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms