Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cwc22Q8C5N3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cwc22Q8C5N3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cwc22Q8C5N3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cwc22Q8C5N3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cwc22Q8C5N3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cwc22Q8C5N3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cwc22Q8C5N3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cwc22Q8C5N3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cwc22Q8C5N3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cwc22Q8C5N3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cwc22Q8C5N3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cwc22Q8C5N3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Cwc22Q8C5N3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cwc22Q8C5N3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cwc22Q8C5N3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cwc22Q8C5N3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cwc22Q8C5N3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cwc22Q8C5N3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Cwc22Q8C5N3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cwc22Q8C5N3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Cwc22Q8C5N3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Cwc22Q8C5N3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cwc22Q8C5N3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cwc22Q8C5N3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cwc22Q8C5N3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cwc22Q8C5N3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cwc22Q8C5N3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cwc22Q8C5N3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cwc22Q8C5N3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cwc22Q8C5N3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cwc22Q8C5N3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cwc22Q8C5N3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cwc22Q8C5N3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cwc22Q8C5N3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cwc22Q8C5N3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cwc22Q8C5N3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cwc22Q8C5N3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cwc22Q8C5N3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cwc22Q8C5N3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
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