Protein–RNA interactions for Protein: Q8C494

Prr33, Proline-rich protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr33Q8C494 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr33Q8C494 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr33Q8C494 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr33Q8C494 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr33Q8C494 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr33Q8C494 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr33Q8C494 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prr33Q8C494 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr33Q8C494 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms