Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1Y8

Ccz1, Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccz1Q8C1Y8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccz1Q8C1Y8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccz1Q8C1Y8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccz1Q8C1Y8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccz1Q8C1Y8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccz1Q8C1Y8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccz1Q8C1Y8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccz1Q8C1Y8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccz1Q8C1Y8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccz1Q8C1Y8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccz1Q8C1Y8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccz1Q8C1Y8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccz1Q8C1Y8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccz1Q8C1Y8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccz1Q8C1Y8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccz1Q8C1Y8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccz1Q8C1Y8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccz1Q8C1Y8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccz1Q8C1Y8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccz1Q8C1Y8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccz1Q8C1Y8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms