Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZL8

Lmo3, LIM domain only protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo3Q8BZL8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmo3Q8BZL8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmo3Q8BZL8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms