Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pdcl3Q8BVF2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdcl3Q8BVF2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdcl3Q8BVF2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdcl3Q8BVF2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdcl3Q8BVF2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms