Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV0

Spock3, Testican-3, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock3Q8BKV0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spock3Q8BKV0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spock3Q8BKV0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spock3Q8BKV0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spock3Q8BKV0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spock3Q8BKV0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spock3Q8BKV0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spock3Q8BKV0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spock3Q8BKV0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spock3Q8BKV0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spock3Q8BKV0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spock3Q8BKV0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spock3Q8BKV0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spock3Q8BKV0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spock3Q8BKV0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spock3Q8BKV0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Spock3Q8BKV0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spock3Q8BKV0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spock3Q8BKV0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spock3Q8BKV0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spock3Q8BKV0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spock3Q8BKV0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spock3Q8BKV0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spock3Q8BKV0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms