Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
6820408C15RikQ8BJX2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
6820408C15RikQ8BJX2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
6820408C15RikQ8BJX2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
6820408C15RikQ8BJX2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms