Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup93Q8BJ71 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup93Q8BJ71 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup93Q8BJ71 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup93Q8BJ71 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup93Q8BJ71 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup93Q8BJ71 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup93Q8BJ71 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup93Q8BJ71 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup93Q8BJ71 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup93Q8BJ71 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup93Q8BJ71 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup93Q8BJ71 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup93Q8BJ71 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup93Q8BJ71 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nup93Q8BJ71 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup93Q8BJ71 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup93Q8BJ71 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup93Q8BJ71 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms