Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmd3Q8BHD4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmd3Q8BHD4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmd3Q8BHD4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms