Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Bhlhe23Q8BGW3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms