Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg4dQ8BGV9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4dQ8BGV9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms