Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q8BGC1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8BGC1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8BGC1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8BGC1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8BGC1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q8BGC1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8BGC1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8BGC1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8BGC1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8BGC1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8BGC1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8BGC1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8BGC1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8BGC1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8BGC1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8BGC1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8BGC1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8BGC1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8BGC1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8BGC1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8BGC1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8BGC1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8BGC1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8BGC1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8BGC1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8BGC1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8BGC1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8BGC1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8BGC1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8BGC1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8BGC1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8BGC1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8BGC1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms