Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG67

Efr3a, Protein EFR3 homolog A, mousemouse

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Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3aQ8BG67 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efr3aQ8BG67 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Efr3aQ8BG67 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Efr3aQ8BG67 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efr3aQ8BG67 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efr3aQ8BG67 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efr3aQ8BG67 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efr3aQ8BG67 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efr3aQ8BG67 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efr3aQ8BG67 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efr3aQ8BG67 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efr3aQ8BG67 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efr3aQ8BG67 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efr3aQ8BG67 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efr3aQ8BG67 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efr3aQ8BG67 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efr3aQ8BG67 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efr3aQ8BG67 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efr3aQ8BG67 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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