Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc50Q810U5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc50Q810U5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc50Q810U5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms