Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp8Q80U87 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms