Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmc8Q7TN58 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmc8Q7TN58 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmc8Q7TN58 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms