Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nemp1Q6ZQE4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nemp1Q6ZQE4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nemp1Q6ZQE4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms