Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot1Q6ZQ08 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot1Q6ZQ08 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot1Q6ZQ08 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms