Protein–RNA interactions for Protein: Q6R5N8

Tlr13, Toll-like receptor 13, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr13Q6R5N8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tlr13Q6R5N8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr13Q6R5N8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr13Q6R5N8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms