Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc82Q6PG04 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc82Q6PG04 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc82Q6PG04 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms