Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf1cQ6PDZ2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Taf1cQ6PDZ2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Taf1cQ6PDZ2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms