Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AtminQ6P9S1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AtminQ6P9S1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AtminQ6P9S1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms