Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtl3Q6P1Y1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtl3Q6P1Y1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtl3Q6P1Y1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms