Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retreg2Q6NS82 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retreg2Q6NS82 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retreg2Q6NS82 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms