Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TroQ6DIC6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TroQ6DIC6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TroQ6DIC6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TroQ6DIC6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TroQ6DIC6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TroQ6DIC6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TroQ6DIC6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TroQ6DIC6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TroQ6DIC6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TroQ6DIC6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TroQ6DIC6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TroQ6DIC6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TroQ6DIC6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TroQ6DIC6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TroQ6DIC6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TroQ6DIC6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TroQ6DIC6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TroQ6DIC6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TroQ6DIC6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TroQ6DIC6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms