Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6DFW0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6DFW0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q6DFW0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q6DFW0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q6DFW0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q6DFW0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q6DFW0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q6DFW0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q6DFW0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q6DFW0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q6DFW0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q6DFW0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q6DFW0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q6DFW0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q6DFW0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q6DFW0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q6DFW0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q6DFW0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q6DFW0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q6DFW0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q6DFW0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q6DFW0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q6DFW0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q6DFW0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q6DFW0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q6DFW0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q6DFW0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q6DFW0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q6DFW0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q6DFW0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q6DFW0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q6DFW0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q6DFW0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q6DFW0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Q6DFW0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q6DFW0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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