Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3rf1Q69ZI1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3rf1Q69ZI1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3rf1Q69ZI1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3rf1Q69ZI1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3rf1Q69ZI1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3rf1Q69ZI1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3rf1Q69ZI1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3rf1Q69ZI1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3rf1Q69ZI1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3rf1Q69ZI1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3rf1Q69ZI1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3rf1Q69ZI1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3rf1Q69ZI1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3rf1Q69ZI1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sh3rf1Q69ZI1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3rf1Q69ZI1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
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