Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc8eQ66JT1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc8eQ66JT1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms