Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NinQ61043 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NinQ61043 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NinQ61043 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NinQ61043 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NinQ61043 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NinQ61043 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NinQ61043 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NinQ61043 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NinQ61043 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NinQ61043 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NinQ61043 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NinQ61043 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NinQ61043 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NinQ61043 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NinQ61043 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NinQ61043 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NinQ61043 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NinQ61043 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NinQ61043 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NinQ61043 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NinQ61043 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NinQ61043 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NinQ61043 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NinQ61043 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NinQ61043 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NinQ61043 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NinQ61043 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NinQ61043 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NinQ61043 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NinQ61043 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NinQ61043 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NinQ61043 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NinQ61043 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NinQ61043 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NinQ61043 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NinQ61043 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NinQ61043 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NinQ61043 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NinQ61043 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NinQ61043 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NinQ61043 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NinQ61043 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NinQ61043 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NinQ61043 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NinQ61043 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NinQ61043 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NinQ61043 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NinQ61043 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NinQ61043 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NinQ61043 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NinQ61043 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NinQ61043 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NinQ61043 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NinQ61043 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NinQ61043 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NinQ61043 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NinQ61043 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NinQ61043 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NinQ61043 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NinQ61043 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NinQ61043 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NinQ61043 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NinQ61043 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NinQ61043 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NinQ61043 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NinQ61043 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NinQ61043 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NinQ61043 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NinQ61043 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NinQ61043 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NinQ61043 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NinQ61043 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NinQ61043 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NinQ61043 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NinQ61043 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NinQ61043 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NinQ61043 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NinQ61043 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NinQ61043 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NinQ61043 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NinQ61043 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NinQ61043 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NinQ61043 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NinQ61043 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NinQ61043 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NinQ61043 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NinQ61043 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NinQ61043 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NinQ61043 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NinQ61043 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NinQ61043 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NinQ61043 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NinQ61043 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NinQ61043 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NinQ61043 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NinQ61043 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NinQ61043 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NinQ61043 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NinQ61043 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms