Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mkrn3Q60764 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mkrn3Q60764 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Mkrn3Q60764 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mkrn3Q60764 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms