Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Csnk2a1Q60737 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csnk2a1Q60737 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms