Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxd4Q60688 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms