Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm1Q60636 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm1Q60636 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm1Q60636 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms